Les fichiers ZIP sont généralement destinés à un usage sous Microsoft Windows. Le format de compression privilégié sous Linux est GZip (.gz) ou le format Tarball (.tar.gz).

Il est néanmoins possible de compresser et décompresser des fichiers ZIP à l'aide de zip/unzip, disponible sous la plupart des distributions.

Pour compresser un ensemble de fichiers, l'usage est le suivant :
zip -r nom_du_fichier.zip repertoire_ou_fichier
Le commutateur -r indique que le contenu du répertoire doit être compressé ainsi que ses sous-répertoires.

Pour décompresser un fichier, l'usage est le suivant :
unzip nom_du_fichier.zip -d destination