D'accord donc par exemple si j'ai 3 tables ça donne ça :
while ($nbre_mots < sizeof($motclef)) {
if (strlen($motclef[$nbre_mots]) > 2) {
$like="%$motclef[$nbre_mots]%";
$query_nom = mysql_query ("SELECT lien.$table1, nom.$table1,lien.$table2,nom.$table2,lien.$table3,nom.$table3, FROM $table1,$table2,$table3 WHERE (nom.$table1 LIKE '$like') AND nom.table2 LIKE '$like' AND nom.table3 LIKE '$like' ");

while ($row_nom = mysql_fetch_array($query_nom)) {

echo '<a href="'.$row[0].'">'.$row[1].'</a>';
echo '<a href="'.$row[2].'">'.$row[3].'</a>';
echo '<a href="'.$row[4].'">'.$row[5].'</a>';
}
}
$nbre_mots++;
}

Ne manque-t-il pas $ ?
WHERE (nom.$table1 LIKE '$like') AND nom.$table2 LIKE '$like' AND nom.$table3 LIKE '$like' ");