Ben il suffit juste de faire :

double tab[255];
...
while( pointeur != NULL )
{
// Cherche les autres separateur
pointeur = strtok( NULL, separateur );
if ( pointeur != NULL )
{
tab[nb_mot]=aotf(pointeur);
nb_mot++; // increment du nombre de mot
}
}
...

Non ?

Bonne chance