Salut Julien,
Non, je n'ai pas eu vraiment de solutions, pas avec i-tunes en tout cas.
Je règle parfois le problème avec dBpowerAMP Music, mais pas systématiquement. Je te laisse l'adresse du site de téléchargement de ce petit utilitaire qui au passage dépanne bien pour transcoder.
http://www.01net.com/windows/Multimedia/encodeurs_et_decodeurs/fiches/12176.html
En espérant que cela t'aide. Mais quand c'est du .aac, je laisse tomber.
Bern@rd