La loi dit que tu es responsable de ce qui sort de ton ordinateur.

Exacte.
Mais personne ne sait ce qui sort de ton ordinateur.
Pas même toi.

en cas de cryptage tu ne peux pas utiliser n'importe quoi.

ça dépend des pays.
Légalement en France, actuellement, c'est totalement libre, sauf en ce qui concerne "les fournisseurs de services cryptographiques", c'est à dire les éditeurs de logiciels de cryptographique ou les sociétés qui proposent des services cryptographiques (VPN, PKI...).
ça ne concerne pas les particuliers.

Les particuliers ont seulement l'obligation de remettre leurs clés de chiffrement sur injonction judiciaire.
Mais comme avec Freenet tu ne connais pas les clés des données stockées sur ton disque dur...

Ils pourraient seulement t'obliger à remettre ta clé privée Freenet.
Mais cela ne leur permettrait même pas d'effacer tes documents (l'effacement de documents de Freenet est actuellement impossible.)